| طراحی و مقایسه دو سازه ایمنوانفورماتیکی تحریک کننده ایمنی هومورال علیه باکتری سالمونلا تیفی |
| کد مقاله : 1473-MVTCONF (R1) |
| نویسندگان |
|
فاطمه بیرانوند *1، نعمت شمس2، امین جایدری3، نرگس نظیفی4، پیمان خادمی2 1دانشجوی کارشناسی ارشد گروه میکروبیولوژی و موادغذایی دانشکده دامپزشکی دانشگاه لرستان 2عضو هئیت علمی 3عضو هئیت علمی دانشگاه لرستان 4بیوتکنولوژی، گروه علوم پایه، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه لرستان |
| چکیده مقاله |
| سالمونلا تیفی یک باسیل گرم‌منفی از خانواده انتروباکتریاسه می‌باشد، که عامل بیماری حصبه است. بهترین راه پیشگیری از بیماری‌ها استفاده از واکسن‌هایی با کمترین عوارض می‌باشد. با هدف دست‌یابی به یک سازه واکسنی مبتنی بر اپی‌توپ اختصاصی، ابتدا ازمرکز داده NCBI برای استخراج پروتئوم باکتری سالمونلا تیفی استفاده شد. سپس از نظر آنتی‌ژنسیتی و آلرژن‌سیتی مورد بررسی قرار گرفت. برای پیش‌بینی اپی‌توپ‌های تخصصی BCell از پروتئین‌های غربال شده از مراحل قبلی، از دو سرور IEDB و ABCpred استفاده شد. با استفاده از اپی‌توپ‌های بدست آمده، دو سازه نوترکیب طراحی شد. هر دوسازه دارای دو دومین ادجوانتی و اپی‌توپی بودند. تفاوت این دو سازه در تعداد تکرار اپی‌توپ‌ها و لینکرها بود. سپس خواص فیزیکوشیمیایی آنها توسط سرورProtPorom بررسی شد. در نهایت ساختار دوم وسوم پیش بینی شدند. از ارزیابی آنتی‌ژنسیتی و آلرژن‌سیتی پروتئوم 7 پروتئین غربال شد. پیش‌بینی اپی-توپ‌ها انجام و طراحی سازها توسط نرم‌افزارها صورت گرفت. براساس نتایج به دست آمده از سرور ProtPorom، سازه اول با طول 328 اسید آمینه، دارای وزن مولکولی 34875.06 دالتون، نقطه ایزوالکتریک 33/9، شاخص آلیفاتیک 35/63، شاخص GRAVY 915/0- و شاخص ناپایداری 19/38 بود در حالی که در سازه دوم به ترتیب480 ، 20/50899 دالتون، 68/9، 85/50 ، 161/1- و 13/31می‌باشند. سپس با پیش‌بینی ساختارها مشخص شد که سازه اول دارای %70/74 آلفا‌هلیکس، %05/3 صفحات‌گسترده 26%/22رندوم‌کویل و درحالی که این موارد در سازه دوم %46/41، %46/6، %08/52 می‌باشند. درنهایت ساختار سوم سازه دوم که با توجه به نتایج دریافتی از مراحل قبل انتخاب گردید توسط سرورI-TASSR پیش‌بینی گردید و توسط نرم‌افزار PyMol آشکارسازی شد. |
| کلیدواژه ها |
| پروتئوم، واکسن، B Cell، سالمونلا تیفی، پیش بینی اپی‌توپ |
| وضعیت: پذیرفته شده برای ارائه شفاهی |
