تشخیص مولکولی و تجزیه تحلیل فیلوژنتیک شیوع ویروس بیماری لامپی اسکین درایران
کد مقاله : 1328-MVTCONF
نویسندگان
غلامحسین کبیری چنار1، غلامرضا محمدی *2، مریم ترابی3، محمد رشتی باف4
1دانش آموخته دانشکده دامپزشکی دانشگاه فردوسی مشهد
2استاد گروه علوم درمانگاهی ، بهداشت وپیشگیری بیماری های دامی دانشکده دامپزشکی دانشگاه فردوسی مشهد
3کارشناس ارشد آزمایشگاه تشخیص اداره کل دامپزشکی خراسان رضوی
4کارشناس ارشد اداره کل دامپزشکی خزاسان رضوی
چکیده مقاله
بیماری لامپی اسکین (LSD) یک بیماری ویروسی ویرانگر در گاو است که اخیراً از آفریقا به کشورهای خاورمیانه گسترش یافته است. هدف از مطالعه حاضر بررسی ارتباط بین ویروس‌های بیماری لامپی اسکین (LSDV) جدا شده از مناطق مختلف ایران و منشاء و انتشار این ویروس‌ها بوده است. در این مطالعه، از 228 کانون رخداد مظنون به شیوع بیماری لامپی اسکین 184 کانون در 22 استان براساس نشانه های درمانگاهی مورد تایید قرار گرقته است. در ضمن نمونه ها جهت آزمایش به روش کمی پلی مراز Real Time PCR از 9 استان کشور به تعداد 34 نمونه دریافت و در آزمایشگاه تشخیص اداره کل دامپزشکی خراسان رضوی مورد آزمایش قرار گرفت . از تعداد 34 نمونه ، 26 نمونه در 7 استان در آزمایش کمی پلی مراز مثبت شدند. تعداد 15 نمونه ویروس لامپی اسکین ، با تحت روش توالی یابی مستقیم Sanger-dideoxy قرار گرفتند. انجام جستجوی NCBI-Blast در توالی‌های بررسی‌شده نشان داد که همولوگ‌ ترین توالی‌هایی که اکثر این توالی‌ها با آن‌ها همسو هستند، توالی‌های ویروس Lumpy Skin Disease Virus (GenBank MN642592.1) می باشند. درخت فیلوژنیکی رسم شده توالی های بدست آمده ، بیشترین شباهت را به جدایه‌های آفریقایی ، مانند کنیا (GenBank MN072619.1) و آسیایی مانند هند (GenBank MIN995838.1) داشتند. نتیجه گیری شد که شیوع بیماری لامپی اسکین احتمالاً در ایران با ورود ویروس های بیماری لامپی اسکین از کشورهای همسایه رخ داده است . اطلاعات توالی نوکلئوتیدی P32 به دست آمده منبع ارزشمندی در شناخت ماهیت ژنتیکی و اپیدمیولوژی مولکولی جدایه های ویروس بیماری لامپی اسکین محلی است.
کلیدواژه ها
بیماری لامپی اسکین . تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک. ژن P32، روش کمی پلیمراز Real Time PCR
وضعیت: پذیرفته شده برای ارائه شفاهی