| مروری بر کاربردهای فناوری توالی‌یابی کل ژنوم در پایش عوامل بیماری‌زای باکتریایی طیور |
| کد مقاله : 1018-MVTCONF |
| نویسندگان |
|
سارا میرزائی * استادیار گروه دام، طیور و آبزیان پژوهشکده کشاورزی سازمان پژوهش های علمی و صنعتی ایران |
| چکیده مقاله |
| فناوری توالی‌یابی کل ژنوم پتانسیل فراهم کردن حجم اطلاعات زیاد از جدایه‌های میکروبی شامل گونه‌ها، نوع سویه‌ها، مقاومت آنتی‌بیوتیکی و حدت را در زمان کوتاه دارد. در بهداشت عمومی، پایش با استفاده از توالی‌یابی کل ژنوم به طور معمول عوامل بیماری‌زای ایجاد کننده همه‌گیری‌ها، عوامل بیماری‌زای منتقله از راه غذا و عوامل بیماری‌زای دارای مقاومت‌های آنتی‌بیوتیکی چندگانه را هدف قرار می‌دهد. پلتفرم‌های توالی‌یابی مختلفی وجود دارند که هرکدام از نظر شیمی توالی‌یابی، بازده (طول خوانش، تعداد توالی‌ها)، صحت و هزینه با یکدیگر متفاوت هستند، با این حال روش کلی کار در آنها مشابه و شامل استخراج DNA، آماده کردن کتابخانه از طریق قطعه‌قطعه کردن DNA به روش مکانیکی و یا آنزیمی و اضافه کردن آداپتورها و بارکدها/ شاخص‌ها و تکثیر، آماده‌سازی الگو و توالی‌یابی اتوماتیک است. مطالعات مختلفی با بکارگیری فناوری توالی‌یابی کل ژنوم روی عوامل بیماری‌زای مهم طیور از جمله، سالمونلا، کلامیدیا، اشریشیا کلی و کمپیلوباکتر که برخی از آنها از نظر بهداشت عمومی نیز حائز اهمیت هستند در کشورهای مختلف دنیا صورت گرفته است. نتایج مطالعات مذکور نشان داد که به کمک فناوری توالی‌یابی کل ژنوم می‌توان مقاومت ضدمیکروبی و همچنین پتانسیل بیماری‌زایی عوامل باکتریایی را با صحت زیاد پیش‌بینی نمود و از این داده‌ها در پایش عوامل بیماری‌زا بهره برد. |
| کلیدواژه ها |
| توالی‌یابی کل ژنوم، عوامل بیماری‌زای باکتریایی، طیور، پایش بیماری |
| وضعیت: پذیرفته شده برای ارسال فایل های ارائه پوستر |
